Protein–RNA interactions for Protein: Q80V62

Fancd2, Fanconi anemia group D2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2Q80V62 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Fancd2Q80V62 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Fancd2Q80V62 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms