Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Polr2eQ80UW8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Polr2eQ80UW8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms