Protein–RNA interactions for Protein: Q80U49

Cep170b, Centrosomal protein of 170 kDa protein B, mousemouse

Predictions only

Length 1,574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep170bQ80U49 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep170bQ80U49 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep170bQ80U49 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms