Protein–RNA interactions for Protein: Q80TV8

Clasp1, CLIP-associating protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clasp1Q80TV8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Clasp1Q80TV8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Clasp1Q80TV8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms