Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdh8Q7TSK3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdh8Q7TSK3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdh8Q7TSK3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdh8Q7TSK3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdh8Q7TSK3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdh8Q7TSK3 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdh8Q7TSK3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdh8Q7TSK3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pcdh8Q7TSK3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pcdh8Q7TSK3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms