Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dsg1bQ7TSF1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dsg1bQ7TSF1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms