Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ckap2lQ7TS74 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ckap2lQ7TS74 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms