Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prrc2bQ7TPM1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prrc2bQ7TPM1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms