Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN99

Cpeb3, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 716 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpeb3Q7TN99 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpeb3Q7TN99 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms