Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HhipQ7TN16 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HhipQ7TN16 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HhipQ7TN16 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HhipQ7TN16 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HhipQ7TN16 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
HhipQ7TN16 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HhipQ7TN16 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HhipQ7TN16 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms