Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf139Q7TMV1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf139Q7TMV1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf139Q7TMV1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rnf139Q7TMV1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf139Q7TMV1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf139Q7TMV1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf139Q7TMV1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf139Q7TMV1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf139Q7TMV1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rnf139Q7TMV1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rnf139Q7TMV1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms