Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nme8Q715T0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nme8Q715T0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms