Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ube2r2Q6ZWZ2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2r2Q6ZWZ2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms