Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpl35Q6ZWV7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rpl35Q6ZWV7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rpl35Q6ZWV7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpl35Q6ZWV7 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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