Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Syne1Q6ZWR6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms