Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ncapd3Q6ZQK0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms