Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Topbp1Q6ZQF0 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Topbp1Q6ZQF0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Topbp1Q6ZQF0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms