Protein–RNA interactions for Protein: Q6VZZ7

Opn5, Opsin-5, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn5Q6VZZ7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Opn5Q6VZZ7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Opn5Q6VZZ7 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms