Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
Rhox8Q6VSS7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rhox8Q6VSS7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms