Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sdk2Q6V4S5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sdk2Q6V4S5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms