Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Timd4Q6U7R4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Timd4Q6U7R4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms