Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ptx4Q6RUU0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ptx4Q6RUU0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms