Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGE7

Slc6a7, Sodium-dependent proline transporter, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a7Q6PGE7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slc6a7Q6PGE7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Slc6a7Q6PGE7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms