Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Taf1cQ6PDZ2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Taf1cQ6PDZ2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms