Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dtx4Q6PDK8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dtx4Q6PDK8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms