Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mfsd13aQ6PDE8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms