Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smarcd3Q6P9Z1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smarcd3Q6P9Z1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms