Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp49Q6P9L4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms