Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3E7

Hdac10, Histone deacetylase 10, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac10Q6P3E7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hdac10Q6P3E7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hdac10Q6P3E7 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms