Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kdm2bQ6P1G2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kdm2bQ6P1G2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms