Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Slx4Q6P1D7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Slx4Q6P1D7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms