Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Soga3Q6NZL0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Soga3Q6NZL0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms