Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gpbp1Q6NXH3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gpbp1Q6NXH3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms