Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD0

Frem2, FRAS1-related extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem2Q6NVD0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Frem2Q6NVD0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Frem2Q6NVD0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms