Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atg16l2Q6KAU8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atg16l2Q6KAU8 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms