Protein–RNA interactions for Protein: Q6IE21

Otud6a, OTU domain-containing protein 6A, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6aQ6IE21 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Otud6aQ6IE21 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Otud6aQ6IE21 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms