Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hecw2Q6I6G8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hecw2Q6I6G8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms