Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q6DFW0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Q6DFW0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms