Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Zcchc2Q69ZB8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Zcchc2Q69ZB8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms