Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk13Q69ZA1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk13Q69ZA1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms