Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pkp4Q68FH0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkp4Q68FH0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms