Protein–RNA interactions for Protein: Q64674

Srm, Spermidine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrmQ64674 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SrmQ64674 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SrmQ64674 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SrmQ64674 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SrmQ64674 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SrmQ64674 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrmQ64674 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrmQ64674 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrmQ64674 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrmQ64674 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SrmQ64674 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SrmQ64674 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SrmQ64674 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SrmQ64674 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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SrmQ64674 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SrmQ64674 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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