Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

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Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tbr1Q64336 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Tbr1Q64336 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tbr1Q64336 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Tbr1Q64336 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tbr1Q64336 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Tbr1Q64336 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms