Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tfe3Q64092 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Tfe3Q64092 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms