Protein–RNA interactions for Protein: Q64016

Defa17, Alpha-defensin 17 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa17Q64016 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Defa17Q64016 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Defa17Q64016 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Defa17Q64016 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Defa17Q64016 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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Defa17Q64016 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Defa17Q64016 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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