Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Pou4f3Q63955 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Pou4f3Q63955 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms