Protein–RNA interactions for Protein: Q62520

Zic2, Zinc finger protein ZIC 2, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic2Q62520 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Zic2Q62520 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Zic2Q62520 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms