Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CochQ62507 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CochQ62507 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CochQ62507 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CochQ62507 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CochQ62507 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CochQ62507 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CochQ62507 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CochQ62507 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CochQ62507 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CochQ62507 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CochQ62507 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CochQ62507 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CochQ62507 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CochQ62507 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CochQ62507 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CochQ62507 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CochQ62507 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CochQ62507 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CochQ62507 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CochQ62507 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CochQ62507 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms