Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vil1Q62468 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Vil1Q62468 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms