Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vat1Q62465 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vat1Q62465 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms